Le Service Transport a 2 réseaux de bus, un pour le site d'Uccle et l'autre pour le site de Berkendael. 

Chaque jour, 55 bus arrivent à Uccle et 58 en partent pour ramener les enfants à la maison et en garderie. Pour Berkendael, ce sont 22 bus qui arrivent le matin à l'école et 23 qui repartent l'après-midi.

Les véhicules ne sont ni la propriété de l'APEEE Services ni de l'école, et les chauffeurs ne sont pas directement engagés par l'APEEE Services. Le Service Transport fait appel à 15 compagnies externes qui mettent à disposition véhicule(s)+chauffeur(s) afin d'assurer le transport quotidien des élèves.

Le Service Transport négocie chaque année ses contrats avec les différentes compagnies qui doivent suivre un cahier des charges imposé par le Service.

Sous l'impulsion du Comité de Gestion et avec l'accord du Conseil d’Administration de l'APEEE Services ainsi que de l’Assemblée Générale, le Service poursuit depuis 2020 sa transition écologique vers un service de transport scolaire zéro émission, notamment pour réduire l’impact des émissions polluantes sur les élèves. L’EEB1 a d’ailleurs été la première école de Belgique à utiliser un bus scolaire électrique.

L'objectif ambitieux était d'arriver à 100% de bus électriques d'ici 2025 en augmentant progressivement le nombre de bus en service. Cette prévision a été revue au fur et à mesure, en tenant compte du contexte géopolitique mondial, mais l'intention et l'engagement du Service, du Comité et de l'APEEE Services dans son ensemble restent forts.

Progression de la transition écologique au fil des années :

• 2020-2021 : 02/76 = 2,7 %
• 2021-2022 : 05/77 = 6,5 %
• 2022-2023 : 09/77 = 12 %
• 2023-2024 : 17/78 = 22 %
• 2024-2025 : 24/76 = 32 %
• 2025-2026 : 31/77 = 40 %
• Prévision 2026-2027 : 41/73 = 56 %